按照传统的科研管理模式，项目申报成功后基本由科研课题组独立负责科研项目的研究和执行，除规定的中期和节点工作报告外，基本都在项目结束时期向项目下达部门提出结题和验收申请，期间基本无必须的质量管理要求；项目完成质量也只有在项目完成后相关科研管理人员和专家组成验收小组对科研项目完成情况及质量进行验收评价，一旦出现问题，已无时间改进，往往影响整个科研项目的完成。

基于ISO9000的水产科研管理体系控制方法，是对科研项目过程中任务分解与执行进度由原甘特图表分解细化到对科研项目分段树立里程碑，对执行中关键点的一组输入和输出进行分解，使科研人员始终能清楚地看到目标，容易产生紧迫感，通过努力到达每一个里程碑点，最终顺利实现整体目标；管理人员也可根据分解后的里程碑点对一些阶段结果进行监督评审。另外在整个科研过程中，由相关科研管理人员和专家组成评审小组，对科研项目在实施过程中的关键节点，按照管理文件要求，对输入和输出各种要素和结果进行评审，评审内容包括：科研进度、研究结果、经费、科研资料与记录、仪器设备等，并得出评审意见反馈给科研课题组，确保每个阶段和过程的研究结果符合要求，力求尽早发现问题、及时纠正，进而提高整个科研项目的成功率。