就国内的现状来看，通过ISO9000认证的企业远远多于已实施ERP的企业。因此，在先上ISO9000之后再上ERP项目的情况居多。这种情况的优点是：有实施ISO9000的基础，企业对八项质量管理原则，过程方法，PDCA循环等管理观念有了深入的认识和体会，也形成了对各项业务流程的有效控制机制，这正为实施EPR提供了思想意识基础和约束控制手段。这种情况的具体做法是；在实施EPR的前期借助ISO9000认证已有的培训和实践及ISO9000的程序文件，作业指导书或记录的一部分，纳入到相应的约束和控制之中，推进EPR的实施。随着业务流程重组的展开和软件的二次开发，将企业ISO9000QMS中可以由计算机完成的过程和活动整合到EPR系统中，并将EPR各个模块的报表输出格式统一为ISO9000要求的质量记录，形成一个在一定范围层次上互相渗透的有机整体。

而对于同时期实施两个体系（系统）并希望通过ISO9000质量管理体系认证的企业来说，可以在培训阶段将ISO9000知识和ERP基本原理培训相结合，重点导入八项质量管理原则的理念，以ISO9000标准发要求为主线，阐明质量管理体系的过程控制和记录在EPR中形成的原理。在业务流程重组阶段，在结合ISO9000的过程方法，从考虑过程增值的角度，确定各个过程的输入、输出，控制准则和所需资源，文件记录。之后分别策划人和计算机要完成的活动，对于可以由计算机完成的活动，按上一节所述方法将EPR功能模块逐个“ISO化”，通过二次开发对EPR中的标准化工作流程进行完善和深化；对于由人来完成的活动，可按QMS建立方法和步骤来执行。