由于水产科研项目很多是为完成某一种独特的创新科技产品或服务所做的一次性努力，具有唯一性、一次性、多目标性、生命周期性、相互依赖性和冲突属性的特征，因此在传统的科研管理模式中，如果以项目结果验收为科研管理和质量控制的方法，往往会造成科研过程的失控状况，使得一些水产科研项目由于过程的控制问题造成科研过程的不可重复性和无法再次研究，势必影响科研项目成果顺利有效地产生和科研周期正常进行，造成资源浪费，甚至造成整个科研项目的质量下降。

基于ISO9000的水产科研管理体系控制方法之一是对科研过程进行识别和管理，对识别出的关键过程按管理要求制订关键过程的控制文件，明确关键控制点、关键参数与要素，明确责任人和关键记录要求，必要时应列出关键过程明细表及关键过程控制要求，以确保科研关键过程的质量，将科研管理贯穿到整个科研过程中去，提高科研项目的质量控制度。